A Bandeira do Município de Monteiro Lobato foi instituída pela Lei nº 600, de 03 de maio de 1985, com a seguinte descrição: esquartelado em cruz, o 1º e 4º de verde e o 2º e o 3º de vermelho, com uma cruz de azul coticada de branco, brocante sobre o esquartelado, tendo brocante sobre o cruzamento de seus ramos, um círculo de branco, carregado do Brasão de Armas instituído pela Lei nº 213, de 20 de novembro de 1962.